Descoberta Computacional de Fármacos
1
2024-2025
02038855
Química
Inglês
Português
Presencial
Semestral
6.0
Obrigatória
2º Ciclo - Mestrado
Conhecimentos de Base Recomendados
Conhecimentos básicos em estrutura e função de proteínas e outras biomoléculas.
Métodos de Ensino
Os métodos de ensino a adoptar são baseados em aulas teóricas, aulas teórico-práticas e seminários. Nas aulas teóricas serão abordados os conceitos base subjacentes aos diferentes tópicos. As aulas teórico-práticas serão dedicadas ao desenvolvimento de capacidades na utilização de software relevante relacionado com os tópicos abordados nas aulas teóricas. Adicionalmente, serão levados a cabo pelos estudantes um conjunto de seminários em temas relevantes da unidade curricular.
Resultados de Aprendizagem
Pretende-se com a presente unidade curricular que o estudante fique a conhecer as principais metodologias computacionais usadas e aplicadas na área da descoberta de novos fármacos. Em particular, as bases teóricas destas metodologias e as suas limitações de aplicabilidade. Pretende-se ainda que o estudante seja capaz de, na prática, aplicar algumas destas metodologias à resolução de problemas ou projectos pontuais.
Estágio(s)
NãoPrograma
1. Visão geral do processo de descoberta de fármacos
2. Identificação de alvos farmacológicos
- Proncipais alvos farnacológicos
- Interações Moleculares
- Modelação de alvos: modelação estrutural, dinâmica molecular, QM/MM
- Pesquisa computacional de novos alvos
3. Descoberta de compostos líder
- Rastreio virtual
- Bibliotecas virtuais
- Rastreio virtual baseado na estrutura do alvo: acoplagem molecular; modelos de farmacóforo
- Rastreio virtual baseado no liagante: pesquisas de similaridade, “fingerprints” moleculares; campos de interação molecular
- Medidas de performance em rastreio virtual
4. Optimização de compostps líder
- Descritores moleculares
- QSAR/QSPR
- Abordagens clássicas e abordagens com base em aprendizagem automática e “deep learning”
5. Reposicionamento de fármacos
6. Previsões de toxicidade.
Docente(s) responsável(eis)
Paulo Eduardo Martins de Castro Neves de Abreu
Métodos de Avaliação
Avaliação
Outra: 15.0%
Projecto: 25.0%
Exame: 60.0%
Bibliografia
Dada a progressão rápida de metodologias na área, em cada ano lectivo será fornecido um conjunto de referências bibliográficas com base em artigos de revisão acessíveis publicamente.