Descoberta Computacional de Fármacos

Conhecimentos de Base Recomendados

Conhecimentos básicos em estrutura e função de proteínas e outras biomoléculas.

Métodos de Ensino

Os métodos de ensino a adoptar são baseados em aulas teóricas, aulas teórico-práticas e seminários. Nas aulas teóricas serão abordados os conceitos base subjacentes aos diferentes tópicos. As aulas teórico-práticas serão dedicadas ao desenvolvimento de capacidades na utilização de software relevante relacionado com os tópicos abordados nas aulas teóricas. Adicionalmente, serão levados a cabo pelos estudantes um conjunto de seminários em temas relevantes da unidade curricular. 

Resultados de Aprendizagem

Pretende-se com a presente unidade curricular que o estudante fique a conhecer as principais metodologias computacionais usadas e aplicadas na área da descoberta de novos fármacos. Em particular, as bases teóricas destas metodologias e as suas limitações de aplicabilidade. Pretende-se ainda que o estudante seja capaz de, na prática, aplicar algumas destas metodologias à resolução de problemas ou projectos pontuais.

Estágio(s)

Não

Programa

1. Visão geral do processo de descoberta de fármacos

2. Identificação de alvos farmacológicos

- Proncipais alvos farnacológicos

- Interações Moleculares

- Modelação de alvos: modelação estrutural, dinâmica molecular, QM/MM

- Pesquisa computacional de novos alvos

3. Descoberta de compostos líder

- Rastreio virtual

- Bibliotecas virtuais

- Rastreio virtual baseado na estrutura do alvo: acoplagem molecular; modelos de farmacóforo

- Rastreio virtual baseado no liagante: pesquisas de similaridade, “fingerprints” moleculares; campos de interação molecular

- Medidas de performance em rastreio virtual

4. Optimização de compostps líder

- Descritores moleculares

- QSAR/QSPR

- Abordagens clássicas e abordagens com base em aprendizagem automática e “deep learning”

5. Reposicionamento de fármacos

6. Previsões de toxicidade.

Docente(s) responsável(eis)

Rui Manuel Pontes Meireles Ferreira de Brito

Métodos de Avaliação

Avaliação
Outra: 15.0%
Projecto: 25.0%
Exame: 60.0%

Bibliografia

Dada a progressão rápida de metodologias na área, em cada ano lectivo será fornecido um conjunto de referências bibliográficas com base em artigos de revisão acessíveis publicamente.