"ÓMICAs" Aplicadas
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2024-2025
02038834
Biologia Computacional
Português
Inglês
Presencial
Semestral
6.0
Obrigatória
2º Ciclo - Mestrado
Conhecimentos de Base Recomendados
Não aplicável.
Métodos de Ensino
Metodologias de Ensino:
1. Aulas teórico-práticas com exposição de slides, filmes didáticos e vários exemplos de aplicações práticas.
2. O acompanhamento das aulas teóricas deverá ser feito através da consulta da bibliografia (livros, sites e artigos científicos seleccionados pelos docentes da unidade curricular).
2. Resolução de problemas biológicos através do desenvolvimento prático de projetos de grupo - oral (15%) e apresentação escrita (35%).
3. Exame final (50%; sem consulta).
Resultados de Aprendizagem
Nos últimos anos o aperfeiçoamento e desenvolvimento de várias plataformas tecnológicas tem levado ao aparecimento de um elevado número de dados resultantes das várias ciências "ÓMICAS" entre elas a (meta)genómica, transcriptómica, proteómica e metabolómica. Compreender a contribuição dos dados resultantes das "ÓMICAS" para a resolução de problemas biológicos complexos, tem sido o grande desafio dos últimos anos. O objetivo principal deste unidade curricular é dotar os estudantes de conhecimentos e ferramentas biológicas e computacionais necessárias para a aquisição, integração, processamento, armazenamento e manipulação de dados provenientes de diferentes plataformas de sequenciação e repositórios públicos.
Estágio(s)
NãoPrograma
1. Desenho experimental de estudos de "ÓMICAs".
2. Introdução a plataformas para aquisição de dados ómicos.
3. Utilização dos dados de sequenciação no estudo da metagenómica funcional, taxonómica e comparativa: ferramentas disponíveis e bases de dados de referência.
4. Submissão dos dados de sequenciação em repositórios públicos.
5. Introdução às bases de dados de "ÓMICAs": exemplo do cancro.
6. Pesquisa, aquisição, integração, processamento e armazenamento de bases de dados.
7. Farmacogenómica e terapia direcionada.
8. Vias/redes de análise de dados.
9. Redes de interações proteína-proteína.
10. Proteómica: classificação do "folding", da estrutura à função das proteínas.
11. Estrutura de moléculas biológicas.
12. Complexos proteícos e interacoes moleculares.
13. Visualização de dados.
Docente(s) responsável(eis)
Irina de Sousa Moreira
Métodos de Avaliação
Avaliação
Trabalho de investigação: 50.0%
Exame: 50.0%
Bibliografia
“Bioinformatics for Beginners - Genes, Genomes, Molecular Evolution, Databases and Analytical Tools”, Supratim Choudhuri, 2014, Academic Press.
“Introduction to Proteins: Structure, Function, and Motion, Second Edition”, Amit Kessel, Nir Ben-Tal, 2018, Chapman and Hall/CRC.