"ÓMICAs" Aplicadas

Ano
1
Ano lectivo
2020-2021
Código
02038834
Área Científica
Biologia Computacional
Língua de Ensino
Português
Outras Línguas de Ensino
Inglês
Modo de Ensino
Presencial
Duração
Semestral
Créditos ECTS
6.0
Tipo
Obrigatória
Nível
2º Ciclo - Mestrado

Conhecimentos de Base Recomendados

Não aplicável.

Métodos de Ensino

Metodologias de Ensino:

1. Aulas teórico-práticas com exposição de slides, filmes didáticos e vários exemplos de aplicações práticas.

2. O acompanhamento das aulas teóricas deverá ser feito através da consulta da bibliografia (livros, sites e artigos científicos seleccionados pelos docentes da unidade curricular).

2. Resolução de problemas biológicos através do desenvolvimento prático de projetos de grupo - oral (15%) e apresentação escrita (35%).

3. Exame final (50%; sem consulta).

Resultados de Aprendizagem

Nos últimos anos o aperfeiçoamento e desenvolvimento de várias plataformas tecnológicas tem levado ao aparecimento de um elevado número de dados resultantes das várias ciências "ÓMICAS" entre elas a (meta)genómica, transcriptómica, proteómica e metabolómica. Compreender a contribuição dos dados resultantes das "ÓMICAS" para a resolução de problemas biológicos complexos, tem sido o grande desafio dos últimos anos. O objetivo principal deste unidade curricular é dotar os estudantes de conhecimentos e ferramentas biológicas e computacionais necessárias para a aquisição, integração, processamento, armazenamento e manipulação de dados provenientes de diferentes plataformas de sequenciação e repositórios públicos.

Estágio(s)

Não

Programa

1. Desenho experimental de estudos de "ÓMICAs".

2. Introdução a plataformas para aquisição de dados ómicos.

3. Utilização dos dados de sequenciação no estudo da metagenómica funcional, taxonómica e comparativa: ferramentas disponíveis e bases de dados de referência.

4. Submissão dos dados de sequenciação em repositórios públicos.

5. Introdução às bases de dados de "ÓMICAs": exemplo do cancro.

6. Pesquisa, aquisição, integração, processamento e armazenamento de bases de dados.

7. Farmacogenómica e terapia direcionada.

8. Vias/redes de análise de dados.

9. Redes de interações proteína-proteína.

10. Proteómica: classificação do "folding", da estrutura à função das proteínas.

11. Estrutura de moléculas biológicas.

12. Complexos proteícos e interacoes moleculares.

13. Visualização de dados.

Docente(s) responsável(eis)

Irina de Sousa Moreira

Métodos de Avaliação

Avaliação
Exame: 50.0%
Trabalho de investigação: 50.0%

Bibliografia

“Bioinformatics for Beginners - Genes, Genomes, Molecular Evolution, Databases and Analytical Tools”, Supratim Choudhuri, 2014, Academic Press.

“Introduction to Proteins: Structure, Function, and Motion, Second Edition”, Amit Kessel, Nir Ben-Tal, 2018, Chapman and Hall/CRC.