Biologia Computacional

Conhecimentos de Base Recomendados

Conhecimentos de Álgebra Linear, Cálculo Diferencial e Integral, Equações Diferenciais.

Métodos de Ensino

O ensino é ministrado em sessões teórico-práticas. As aulas são expositivas e incluem exemplos e exercícios de aplicação dos conhecimentos adquiridos. Os alunos realizam ao longo do semestre e no horário de escolaridade obrigatória, pequenos projectos de natureza computacional que envolve a aplicação dos métodos estudados. 

Ao longo do semestre os alunos dispõem de um tempo de orientação tutorial para esclarecimento dos problemas que tenham na aquisição de conhecimentos ou no desenvolvimento de competências necessárias para realizar os trabalhos. 

Resultados de Aprendizagem

A unidade curricular tem como objectivo o estudo qualitativo e quantitativo de vários modelos biológicos e químicos entre os quais destacamos dinâmica de populações, cinética de reacções, dinâmica de doenças infeciosas, crescimento de tumores e libertação de fármacos. Este unidade pretende desenvolver competências na modelação matemática e computacional dos fenómenos anteriores bem como na utilização de ferramentas computacionais.

Estágio(s)

Não

Programa

I - Dinâmica de populações,

II - Cinética de reacções,

III - Dinâmica de doenças infeciosas,

IV - Crescimento de tumores,

V - Libertação de fármacos.

Métodos de Avaliação

Avaliação
Resolução de problemas: 25.0%
Trabalho laboratorial ou de campo: 25.0%
Frequência: 50.0%

Bibliografia

J.D. Murray, Mathematical Biology I - An Introduction, Springer, 2002.

J.D. Murray, Mathematical Biology II – Spatial Models and Biomedical Applications, Springer, 2003.

G. Grassi, M. Grassi, R. Lapasin, I. Colombo, Understanding drug release and absorption mechanisms, CRC Press, 2007.

A. Quarteroni, R. Sacco, F. Saleri, Numerical mathematics, Springer, 2007

L. Simon, J. Ospina, Closed-form solutions for drug transport through controlled-release devices in two and three dimensions, Wiley, 2016