Bioinformática

Conhecimentos de Base Recomendados

-Biologia celular e molecular.

-Bioestatística.

Métodos de Ensino

A disciplina encontra-se dividida em aulas de natureza expositiva e em aulas Práticas-Laboratoriais. Na primeira é exposta a matéria numa vertente mais teórica, sem no entanto deixar de promover a participação activa dos alunos. Pretende-se desenvolver nestes a capacidade de raciocínio e de integração de conhecimentos e estimular o seu espírito crítico. As aulas Práticas vão possibilitar, ao aluno, explorar os conceitos adquiridos. Seguir-se-à uma abordagem orientada ao problema através do lançamento de desafios que relacionem conhecimento interdisciplinar fazendo, sempre que possível, uso de grupos de trabalho e de discussão.

A avaliação baseia-se na realização de uma prova escrita em que serão testados os conhecimentos adquiridos durante as aulas (40% da nota final) e na avaliação da sua prestação durante as aulas PLs pela realização de trabalhos e fichas de avaliação (60% da nota final). Na época de recurso os alunos apenas poderão repetir a componente da prova escrita.

Resultados de Aprendizagem

Conhecer de forma sistemática os principais algoritmos e ferramentas utilizadas em Bioinformática. Em particular, é objetivo focar nos métodos de análise e de anotação de sequências, algoritmos com aplicação em proteómica e na área da biologia de sistemas, e em especial nas redes de regulação genómicas.

Estágio(s)

Não

Docente(s) responsável(eis)

Joel Perdiz Arrais

Métodos de Avaliação

Avaliação
Exame: 40.0%
Trabalho laboratorial ou de campo: 60.0%

Bibliografia

Gusfield, Dan. AlgorithmsonStrings, TreesandSequences: ComputerScienceandComputationalBiology. Cambridge, UK: Cambridge UniversityPress, 1997. ISBN: 0521585198.

Waterman, Michael. Introduction to ComputationalBiology: Maps, Sequences, andGenomes. Boca Raton, FL: CRC Press, 1995. ISBN: 0412993910.

Durbin, Richard, GraemeMitchison, S. Eddy, A. Krogh, and G. Mitchison. BiologicalSequenceAnalysis: ProbabilisticModelsofProteinsandNucleicAcids. Cambridge, UK: Cambridge UniversityPress, 1997. ISBN: 0521629713.

Jones, Neil, and Pavel Pevzner. AnIntroduction to BioinformaticsAlgorithms. Cambridge, MA: MIT Press , 2004. ISBN: 0262101068.